Notebook

In [1]:

%reset -f

In [2]:

# !pip install oaklib==0.5.16-rc1

In [3]:

%%time
from oaklib.selector import get_adapter
semsim = get_adapter(f"semsimian:sqlite:obo:phenio")

CPU times: user 3.35 s, sys: 710 ms, total: 4.06 s
Wall time: 3.15 s

In [4]:

%%time
semsim.termset_pairwise_similarity(
            subjects=["MP:0010771","MP:0002169","MP:0005391","MP:0005389","MP:0005367"],
            objects=["HP:0004325","HP:0000093","MP:0006144"],
            predicates=["rdfs:subClassOf", "BFO:0000050", "UPHENO:0000001"],
            labels=False,
        )

CPU times: user 39.8 s, sys: 3.9 s, total: 43.7 s
Wall time: 43.3 s

Out[4]:

TermSetPairwiseSimilarity(subject_termset=[{'MP:0010771': {'id': 'MP:0010771', 'label': 'integument phenotype (MPO)'}}, {'MP:0005367': {'id': 'MP:0005367', 'label': 'renal/urinary system phenotype (MPO)'}}, {'MP:0002169': {'id': 'MP:0002169', 'label': 'no abnormal phenotype detected (MPO)'}}, {'MP:0005389': {'id': 'MP:0005389', 'label': 'reproductive system phenotype (MPO)'}}, {'MP:0005391': {'id': 'MP:0005391', 'label': 'vision/eye phenotype (MPO)'}}], object_termset=[{'MP:0006144': {'id': 'MP:0006144', 'label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)'}}, {'HP:0004325': {'id': 'HP:0004325', 'label': 'Decreased body weight (HPO)'}}, {'HP:0000093': {'id': 'HP:0000093', 'label': 'Proteinuria (HPO)'}}], subject_best_matches=JsonObj(similarity=JsonObj(**{'MP:0002169': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.1', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='0.6651112623056488', subject_id='MP:0002169'), 'MP:0005367': JsonObj(ancestor_id='UBERON:0001008', ancestor_information_content='6.050689168215567', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.24107142857142858', object_id='HP:0000093', phenodigm_score='1.2077451227901506', subject_id='MP:0005367'), 'MP:0005389': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.38571428571428573', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.3062525878928277', subject_id='MP:0005389'), 'MP:0005391': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.36486486486486486', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.270458034217462', subject_id='MP:0005391'), 'MP:0010771': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.38028169014084506', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.2970210051638302', subject_id='MP:0010771')}), **{'MP:0002169': JsonObj(match_source='MP:0002169', match_source_label='no abnormal phenotype detected (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0005367': JsonObj(match_source='MP:0005367', match_source_label='renal/urinary system phenotype (MPO)', match_target='HP:0000093', match_target_label='Proteinuria (HPO)', score='6.050689168215567'), 'MP:0005389': JsonObj(match_source='MP:0005389', match_source_label='reproductive system phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0005391': JsonObj(match_source='MP:0005391', match_source_label='vision/eye phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0010771': JsonObj(match_source='MP:0010771', match_source_label='integument phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355')}), object_best_matches=JsonObj(similarity=JsonObj(**{'HP:0000093': JsonObj(ancestor_id='UBERON:0001008', ancestor_information_content='6.050689168215567', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.24107142857142858', object_id='MP:0005367', phenodigm_score='1.2077451227901506', subject_id='HP:0000093'), 'HP:0004325': JsonObj(ancestor_id='UPHENO:0001003', ancestor_information_content='1.449244551635026', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.13043478260869565', object_id='MP:0002169', phenodigm_score='0.4347779870685166', subject_id='HP:0004325'), 'MP:0006144': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.38028169014084506', object_id='MP:0010771', phenodigm_score='1.2970210051638302', subject_id='MP:0006144')}), **{'HP:0000093': JsonObj(match_source='HP:0000093', match_source_label='Proteinuria (HPO)', match_target='MP:0005367', match_target_label='renal/urinary system phenotype (MPO)', score='6.050689168215567'), 'HP:0004325': JsonObj(match_source='HP:0004325', match_source_label='Decreased body weight (HPO)', match_target='MP:0002169', match_target_label='no abnormal phenotype detected (MPO)', score='1.449244551635026'), 'MP:0006144': JsonObj(match_source='MP:0006144', match_source_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', match_target='MP:0010771', match_target_label='integument phenotype (MPO)', score='4.4237299124581355')}), average_score=4.361838153856265, best_score=6.050689168215567, metric='ancestor_information_content')

In [5]:

semsim.semsimian_object_cache

Out[5]:

{('BFO:0000050',
  'UPHENO:0000001',
  'rdfs:subClassOf'): <Semsimian at 0x7fe4b888cab0>}

In [6]:

%%time
semsim.termset_pairwise_similarity(
            subjects=["MP:0010771","MP:0002169","MP:0005391","MP:0005389","MP:0005367"],
            objects=["HP:0004325","HP:0000093","MP:0006144"],
            predicates=["rdfs:subClassOf", "BFO:0000050", "UPHENO:0000001"],
            labels=False,
        )

CPU times: user 26 s, sys: 1.74 s, total: 27.7 s
Wall time: 27.6 s

Out[6]:

TermSetPairwiseSimilarity(subject_termset=[{'MP:0005367': {'id': 'MP:0005367', 'label': 'renal/urinary system phenotype (MPO)'}}, {'MP:0005389': {'id': 'MP:0005389', 'label': 'reproductive system phenotype (MPO)'}}, {'MP:0005391': {'id': 'MP:0005391', 'label': 'vision/eye phenotype (MPO)'}}, {'MP:0010771': {'id': 'MP:0010771', 'label': 'integument phenotype (MPO)'}}, {'MP:0002169': {'id': 'MP:0002169', 'label': 'no abnormal phenotype detected (MPO)'}}], object_termset=[{'HP:0000093': {'id': 'HP:0000093', 'label': 'Proteinuria (HPO)'}}, {'MP:0006144': {'id': 'MP:0006144', 'label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)'}}, {'HP:0004325': {'id': 'HP:0004325', 'label': 'Decreased body weight (HPO)'}}], subject_best_matches=JsonObj(similarity=JsonObj(**{'MP:0002169': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.1', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='0.6651112623056488', subject_id='MP:0002169'), 'MP:0005367': JsonObj(ancestor_id='UBERON:0001008', ancestor_information_content='6.050689168215567', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.24107142857142858', object_id='HP:0000093', phenodigm_score='1.2077451227901506', subject_id='MP:0005367'), 'MP:0005389': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.38571428571428573', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.3062525878928277', subject_id='MP:0005389'), 'MP:0005391': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.36486486486486486', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.270458034217462', subject_id='MP:0005391'), 'MP:0010771': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.38028169014084506', object_id='MP:0006144', phenodigm_score='1.2970210051638302', subject_id='MP:0010771')}), **{'MP:0002169': JsonObj(match_source='MP:0002169', match_source_label='no abnormal phenotype detected (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0005367': JsonObj(match_source='MP:0005367', match_source_label='renal/urinary system phenotype (MPO)', match_target='HP:0000093', match_target_label='Proteinuria (HPO)', score='6.050689168215567'), 'MP:0005389': JsonObj(match_source='MP:0005389', match_source_label='reproductive system phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0005391': JsonObj(match_source='MP:0005391', match_source_label='vision/eye phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355'), 'MP:0010771': JsonObj(match_source='MP:0010771', match_source_label='integument phenotype (MPO)', match_target='MP:0006144', match_target_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', score='4.4237299124581355')}), object_best_matches=JsonObj(similarity=JsonObj(**{'HP:0000093': JsonObj(ancestor_id='UBERON:0001008', ancestor_information_content='6.050689168215567', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.24107142857142858', object_id='MP:0005367', phenodigm_score='1.2077451227901506', subject_id='HP:0000093'), 'HP:0004325': JsonObj(ancestor_id='UPHENO:0001003', ancestor_information_content='1.449244551635026', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.44', object_id='MP:0005367', phenodigm_score='0.7985409211301644', subject_id='HP:0004325'), 'MP:0006144': JsonObj(ancestor_id='MP:0000001', ancestor_information_content='4.4237299124581355', ancestor_label='', cosine_similarity='NaN', jaccard_similarity='0.36486486486486486', object_id='MP:0005391', phenodigm_score='1.270458034217462', subject_id='MP:0006144')}), **{'HP:0000093': JsonObj(match_source='HP:0000093', match_source_label='Proteinuria (HPO)', match_target='MP:0005367', match_target_label='renal/urinary system phenotype (MPO)', score='6.050689168215567'), 'HP:0004325': JsonObj(match_source='HP:0004325', match_source_label='Decreased body weight (HPO)', match_target='MP:0005367', match_target_label='renal/urinary system phenotype (MPO)', score='1.449244551635026'), 'MP:0006144': JsonObj(match_source='MP:0006144', match_source_label='increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)', match_target='MP:0005391', match_target_label='vision/eye phenotype (MPO)', score='4.4237299124581355')}), average_score=4.361838153856265, best_score=6.050689168215567, metric='ancestor_information_content')

Semsimian¶

In [7]:

from semsimian import Semsimian

In [8]:

subjects=["MP:0010771","MP:0002169","MP:0005391","MP:0005389","MP:0005367"]
objects=["HP:0004325","HP:0000093","MP:0006144"]
predicates=["rdfs:subClassOf", "BFO:0000050", "UPHENO:0000001"]

In [9]:

semsim

Out[9]:

SemSimianImplementation(resource=OntologyResource(slug='sqlite:obo:phenio', directory=None, scheme='semsimian', format=None, url=None, readonly=False, provider=None, local=False, in_memory=False, data=None, implementation_class=<class 'oaklib.implementations.semsimian.semsimian_implementation.SemSimianImplementation'>, import_depth=None), strict=False, _multilingual=None, autosave=True, exclude_owl_top_and_bottom=True, ontology_metamodel_mapper=None, _converter=None, auto_relax_axioms=None, cache_lookups=False, _edge_index=None, _entailed_edge_index=None, semsimian_object_cache={('BFO:0000050', 'UPHENO:0000001', 'rdfs:subClassOf'): <builtins.Semsimian object at 0x7fe4b888cab0>})

In [10]:

%%time

semsim.resource_path = str(semsim.wrapped_adapter.engine.url).lstrip("sqlite:")
type(semsim.resource_path)

CPU times: user 25 µs, sys: 1 µs, total: 26 µs
Wall time: 30 µs

Out[10]:

str

In [11]:

%%time
new_semsim_obj = Semsimian(spo=None, predicates=predicates, pairwise_similarity_attributes=None, resource_path=semsim.resource_path)

CPU times: user 15.8 s, sys: 1.62 s, total: 17.5 s
Wall time: 17.4 s

In [12]:

new_semsim_obj.get_spo()

Out[12]:

[('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010000'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0005918'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0080300'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000006'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0030000'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041448'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001440'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000040'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041370'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0011582'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000475'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041262'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0040068'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0008785'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0011216'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002964'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0040070'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000468'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015024'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0014502'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020651'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009853'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015063'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0007272'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0006049'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0021800'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0082129'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010712'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5103622'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5003622'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041311'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0084448'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003607'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000465'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001009'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0019232'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041288'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012358'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0040064'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009834'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0021840'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005897'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0011249'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001015'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012141'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010912'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010000'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002905'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012140'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041346'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012139'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020853'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076740'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5102389'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010741'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000032'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015023'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004708'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012475'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000075'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010740'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001436'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041226'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075817'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0004100'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0011842'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0079876'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004381'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003636'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010538'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0008962'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5002389'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0084447'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002880'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000062'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0011250'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009769'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002398'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002389'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004375'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000011'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004249'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002428'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0002813'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0002001'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041407'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002204'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020220'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0002817'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0000118'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075696'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002416'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001442'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004302'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0006058'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000004'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0019222'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015212'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012357'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041258'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009582'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004765'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000383'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0001167'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076727'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0034925'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010758'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076718'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0079872'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020004'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0001155'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020584'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000467'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002495'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005451'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0006717'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012354'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076723'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076703'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002544'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003606'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000153'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015061'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5006049'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010004'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004328'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5102544'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001016'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001474'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076939'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0033127'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012151'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0081581'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041154'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009541'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0000924'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000012'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002470'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002234'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041361'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010543'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010708'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005881'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0011297'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'RO:0002577'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0082301'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0000001'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0015280'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003221'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041374'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0082444'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020003'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5002544'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0011314'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010688'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009544'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000026'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002091'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002896'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002830'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:5106049'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002102'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015021'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010363'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076747'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076941'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0009548'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000061'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002529'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001460'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004288'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001434'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0015026'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001062'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003622'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001010'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002101'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004120'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0005922'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002708'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001008'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0012150'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002513'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010003'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041289'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004710'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0082380'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000000'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0011844'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020041'),
 ('HP:0009582', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010707'),
 ('HP:0009582', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076692'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0051046'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0060255'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0010468'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0048583'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002682'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002791'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0031347'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002784'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0050776'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0008150'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0050789'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0051049'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0032101'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000015'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002831'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002800'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000003'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0019222'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002920'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002759'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0032879'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002788'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0080134'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1900150'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002700'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0090087'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002697'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0002794'),
 ('GO:0002800', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0065007'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:89593'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005291'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:41665'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000061'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010000'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186627'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004120'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0101265'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186623'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001094'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001122'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107301'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001008'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0103175'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0010254'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117571'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000468'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000043'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:30727'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000060'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001105'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003068'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7711'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000041'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:1489341'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:32519'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0108517'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7952'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0011498'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001010'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0018666'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000926'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010316'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7954'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107368'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:00000000'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001477'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107511'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000037'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0030000'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000012'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000465'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0035025'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7742'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0035147'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117570'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001204'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000040'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0100009'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7898'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0012999'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186625'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000030'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2743711'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000000'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010000'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000006'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7776'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:6072'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2759'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:32443'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000922'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107311'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0006910'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0100000'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33208'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33154'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0063722'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000004'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:ENTITY'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001062'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107409'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'OBI:0100026'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107299'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000479'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33511'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186626'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33213'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005423'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000923'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0003063'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010004'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020003'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:1'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186634'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002050'),
 ('ZP:0101265', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075696'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:131567'),
 ('ZP:0101265', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2743709'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0003150'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000001'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'OGMS:0000031'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000016'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0002118'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0001776'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0700096'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0024647'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0003105'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0005039'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000017'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0004828'),
 ('MONDO:0001776', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0050121'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049724'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049587'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0045716'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049927'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0050050'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0051356'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0042775'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0059829'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0052178'),
 ('UPHENO:0045716', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075831'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002896'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002905'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002964'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002830'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002708'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('UPHENO:0075831', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'OGMS:0000031'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000016'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0100338'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0005113'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000001'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0020590'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000368'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0018076'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0002118'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000314'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000017'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0004272'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0006026'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0100336'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0005550'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0006002'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0005247'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('MONDO:0004272', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0700096'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0099081'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0016865'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:30727'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7898'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000043'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33511'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:6072'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0011216'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2743709'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000393'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'RO:0002577'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0030018'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000211'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000000'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000255'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000004'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043232'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0016068'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107851'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:00000000'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000013'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001062'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000383'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0018254'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107296'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010000'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0005090'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020003'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:41665'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:1489341'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:1'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0099080'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0012013'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0018927'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005622'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001477'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0031674'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000003'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043292'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000183'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0100000'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107342'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000030'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186625'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009190'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005575'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000187'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000011'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186634'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001094'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043228'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107301'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010000'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:32443'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7776'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009116'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009128'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043226'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000465'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7952'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001008'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107543'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7711'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0003067'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0131285'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000061'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000000'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0014892'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000468'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7954'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009114'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107584'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020004'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000548'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:32519'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000062'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0030016'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000737'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:ENTITY'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0002917'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002204'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33208'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33154'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0099568'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000548'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2759'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0013269'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000054'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:131567'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107585'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000040'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0030017'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186626'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001439'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107707'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:33213'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0030000'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107340'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117570'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0110165'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117571'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7742'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043229'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009000'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0099512'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000012'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000480'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0100009'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001015'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0014214'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010004'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001630'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0012248'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0005277'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0007016'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107299'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2743711'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000467'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186623'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0005784'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000479'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001512'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107311'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009115'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'OBI:0100026'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:89593'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002816'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005737'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004120'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CL:0002371'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0005145'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000037'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186627'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000006'),
 ('ZP:0016865', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001010'),
 ('ZP:0016865', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0100010'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0008150'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000003'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0048869'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0009987'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0032502'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000015'),
 ('GO:0048869', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043228'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043226'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0006889'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000004'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0001320'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000521'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000003'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001062'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000020'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0000356'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0004638'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0082043'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043229'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000061'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005622'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0001321'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020003'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005575'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000465'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0030000'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000006'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000000'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'FYPO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000040'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000013'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0084004'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0000136'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0067691'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'UPHENO:0001003'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076692'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0001985'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'UPHENO:0001001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0000002'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0110165'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075696'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0043232'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'PATO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020584'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0001322'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'GO:0005811'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000255'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0015280'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'FYPO:0000287'),
 ('FYPO:0000356', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('FYPO:0000356', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000000'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7215'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33392'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00100313'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:2759'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0000465'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33340'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000548'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0000006'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'OBI:0100026'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'RO:0002577'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0002319'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0001016'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33317'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:50557'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00000001'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000255'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00001333'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33208'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00004856'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0000013'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:480117'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:32351'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:43746'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'UBERON:0005423'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7214'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:43738'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0030000'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33213'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:43733'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0020003'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0020003'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007014'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00100556'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00007016'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0000000'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'BFO:0000002'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007006'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0000467'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00100741'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:33154'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0010000'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0011115'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'UBERON:0001062'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000000'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007001'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0000468'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000047'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007344'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0000000'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000040'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:480118'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:ENTITY'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CARO:0000003'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:6072'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0000011'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'UBERON:0000465'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0002371'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00007001'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:197563'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00005146'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'BFO:0000001'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7227'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00100318'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:43845'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0010000'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000003'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000034'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:46877'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0001017'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'BFO:0000004'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'UBERON:0000061'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:131567'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'BFO:0000030'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007008'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:6656'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000338'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:85512'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'UBERON:0004121'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007016'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:88770'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:197562'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:ENTITY'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0000061'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00100532'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7147'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:6960'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:1206794'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0001062'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:32341'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0030000'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:00007002'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'CL:0000048'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:00005093'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0001010'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'FBbt:10000000'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:43741'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7496'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'FBbt:10000000'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0004121'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:32346'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0000003'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:1'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0000006'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0000012'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'NCBITaxon:7203'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0001008'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'CARO:0010004'),
 ('FBbt:00100556', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000004'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'BFO:0000040'),
 ('FBbt:00100556', 'BFO:0000050', 'UBERON:0011216'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006725'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006732'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006082'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006807'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0046452'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1901360'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006761'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0009396'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0018130'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1901566'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0044281'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0042398'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000015'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0044283'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000003'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0042559'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0044271'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0044249'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0009987'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0019752'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0044237'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0043648'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0016053'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0009058'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0051186'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0008152'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1901576'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0043603'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1901564'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0046483'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0019438'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0043650'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0034641'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0042558'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0071704'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0008150'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1901362'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006760'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0046394'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0006575'),
 ('GO:0006761', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0043436'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049587'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0048589'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0050108'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:00000000'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000015'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0040007'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0048856'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0042246'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049781'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0014445'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0031101'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049874'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0006859'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0008150'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0032502'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0012905'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'GO:0031099'),
 ('ZP:0012905', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000003'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0051516'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0015939'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0081436'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0131284'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0014975'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('ZP:0012905', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('MONDO:0000311', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000311'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049707'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049671'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049676'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0059829'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0081999'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049588'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0050121'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049586'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0051091'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049964'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0060333'),
 ('UPHENO:0049676', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0049587'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0000001'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0005046'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0003847'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000017'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000016'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0021094'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0030692'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'OGMS:0000031'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'MONDO:0700096'),
 ('MONDO:0030692', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:2731342'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000004'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:1'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:151340'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:2732415'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'OBI:0100026'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:10239'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:2732421'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000040'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000030'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:2732533'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:333774'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'NCBITaxon:2732092'),
 ('NCBITaxon:333774', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'SO:0000704'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'SO:0001411'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000031'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>',
  'rdfs:subClassOf',
  '<http://identifiers.org/hgnc/649>'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'SO:0000001'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'SO:0000110'),
 ('<http://identifiers.org/hgnc/649>', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0016798'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0047405'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000003'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0016787'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0003824'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0016799'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0003674'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000015'),
 ('GO:0047405', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000015'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'GO:0008150'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0131284'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'GO:0036268'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:00000000'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0015400'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0015398'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'GO:0040011'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('ZP:0015400', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('ZP:0015400', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000003'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076692'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0002371'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0001871'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001010'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000467'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0010000'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0025461'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000004'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002390'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000013'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000040'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002193'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0020584'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0020047'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0012130'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001002'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001005'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000006'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0001927'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0075696'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000548'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'RO:0002577'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0000001'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000764'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000000'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0080300'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000988'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0077197'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000763'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000081'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0004447'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000003'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0001877'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000061'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0041226'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010004'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002536'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000232'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001008'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0010000'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0004120'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0025354'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000255'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0030000'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0001062'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000465'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000012'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CL:0000329'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000000'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0004459'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0005987'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000011'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020003'),
 ('HP:0001927', 'rdfs:subClassOf', 'HP:0000118'),
 ('HP:0001927', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000468'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'GO:0042592'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'GO:0065007'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000002'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000003'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'MP:0005376'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001001'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'MP:0005319'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'MP:0001764'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'MP:0020231'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'PATO:0000001'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'GO:0008150'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000020'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000001'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'MP:0000001'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000015'),
 ('MP:0020231', 'UPHENO:0000001', 'GO:0065008'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('MP:0020231', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000015'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000003'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0005515'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'GO:1990763'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0005488'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'GO:0003674'),
 ('GO:1990763', 'rdfs:subClassOf', 'BFO:0000001'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0000480'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000434'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001501'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107732'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117571'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107307'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0020004'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0076692'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000030'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0000003'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0107298'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:7711'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:117570'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0000314'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0100000'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:00000000'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0002964'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'OBI:0100026'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0108469'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0001488'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:41665'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'UBERON:0002204'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:1'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0000037'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009093'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:186623'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'BFO:0000002'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'UPHENO:0001003'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'CARO:0001010'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0019361'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'ZFA:0009162'),
 ('ZP:0019361', 'UPHENO:0000001', 'NCBITaxon:2759'),
 ('ZP:0019361', 'rdfs:subClassOf', 'ZP:0016229'),
 ...]

In [13]:

%%time
new_semsim_obj.termset_pairwise_similarity(set(subjects), set(objects))

CPU times: user 25.8 s, sys: 3.38 s, total: 29.2 s
Wall time: 30 s

Out[13]:

{'subject_termset': [{'MP:0005391': {'id': 'MP:0005391',
    'label': 'vision/eye phenotype (MPO)'}},
  {'MP:0005367': {'id': 'MP:0005367',
    'label': 'renal/urinary system phenotype (MPO)'}},
  {'MP:0010771': {'id': 'MP:0010771', 'label': 'integument phenotype (MPO)'}},
  {'MP:0005389': {'id': 'MP:0005389',
    'label': 'reproductive system phenotype (MPO)'}},
  {'MP:0002169': {'id': 'MP:0002169',
    'label': 'no abnormal phenotype detected (MPO)'}}],
 'object_termset': [{'MP:0006144': {'id': 'MP:0006144',
    'label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)'}},
  {'HP:0000093': {'id': 'HP:0000093', 'label': 'Proteinuria (HPO)'}},
  {'HP:0004325': {'id': 'HP:0004325',
    'label': 'Decreased body weight (HPO)'}}],
 'subject_best_matches': {'MP:0002169': {'match_source': 'MP:0002169',
   'match_source_label': 'no abnormal phenotype detected (MPO)',
   'match_target': 'MP:0006144',
   'match_target_label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)',
   'score': '4.4237299124581355'},
  'MP:0005367': {'match_source': 'MP:0005367',
   'match_source_label': 'renal/urinary system phenotype (MPO)',
   'match_target': 'HP:0000093',
   'match_target_label': 'Proteinuria (HPO)',
   'score': '6.050689168215567'},
  'MP:0005389': {'match_source': 'MP:0005389',
   'match_source_label': 'reproductive system phenotype (MPO)',
   'match_target': 'MP:0006144',
   'match_target_label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)',
   'score': '4.4237299124581355'},
  'MP:0005391': {'match_source': 'MP:0005391',
   'match_source_label': 'vision/eye phenotype (MPO)',
   'match_target': 'MP:0006144',
   'match_target_label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)',
   'score': '4.4237299124581355'},
  'MP:0010771': {'match_source': 'MP:0010771',
   'match_source_label': 'integument phenotype (MPO)',
   'match_target': 'MP:0006144',
   'match_target_label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)',
   'score': '4.4237299124581355'},
  'similarity': {'MP:0002169': {'ancestor_id': 'MP:0000001',
    'ancestor_information_content': '4.4237299124581355',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.1',
    'object_id': 'MP:0006144',
    'phenodigm_score': '0.6651112623056488',
    'subject_id': 'MP:0002169'},
   'MP:0005367': {'ancestor_id': 'UBERON:0001008',
    'ancestor_information_content': '6.050689168215567',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.24107142857142858',
    'object_id': 'HP:0000093',
    'phenodigm_score': '1.2077451227901506',
    'subject_id': 'MP:0005367'},
   'MP:0005389': {'ancestor_id': 'MP:0000001',
    'ancestor_information_content': '4.4237299124581355',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.38571428571428573',
    'object_id': 'MP:0006144',
    'phenodigm_score': '1.3062525878928277',
    'subject_id': 'MP:0005389'},
   'MP:0005391': {'ancestor_id': 'MP:0000001',
    'ancestor_information_content': '4.4237299124581355',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.36486486486486486',
    'object_id': 'MP:0006144',
    'phenodigm_score': '1.270458034217462',
    'subject_id': 'MP:0005391'},
   'MP:0010771': {'ancestor_id': 'MP:0000001',
    'ancestor_information_content': '4.4237299124581355',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.38028169014084506',
    'object_id': 'MP:0006144',
    'phenodigm_score': '1.2970210051638302',
    'subject_id': 'MP:0010771'}}},
 'object_best_matches': {'HP:0000093': {'match_source': 'HP:0000093',
   'match_source_label': 'Proteinuria (HPO)',
   'match_target': 'MP:0005367',
   'match_target_label': 'renal/urinary system phenotype (MPO)',
   'score': '6.050689168215567'},
  'HP:0004325': {'match_source': 'HP:0004325',
   'match_source_label': 'Decreased body weight (HPO)',
   'match_target': 'MP:0010771',
   'match_target_label': 'integument phenotype (MPO)',
   'score': '1.449244551635026'},
  'MP:0006144': {'match_source': 'MP:0006144',
   'match_source_label': 'increased systemic arterial systolic blood pressure (MPO)',
   'match_target': 'MP:0005391',
   'match_target_label': 'vision/eye phenotype (MPO)',
   'score': '4.4237299124581355'},
  'similarity': {'HP:0000093': {'ancestor_id': 'UBERON:0001008',
    'ancestor_information_content': '6.050689168215567',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.24107142857142858',
    'object_id': 'MP:0005367',
    'phenodigm_score': '1.2077451227901506',
    'subject_id': 'HP:0000093'},
   'HP:0004325': {'ancestor_id': 'UPHENO:0001003',
    'ancestor_information_content': '1.449244551635026',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.43137254901960786',
    'object_id': 'MP:0010771',
    'phenodigm_score': '0.7906733310233626',
    'subject_id': 'HP:0004325'},
   'MP:0006144': {'ancestor_id': 'MP:0000001',
    'ancestor_information_content': '4.4237299124581355',
    'ancestor_label': '',
    'cosine_similarity': 'NaN',
    'jaccard_similarity': '0.36486486486486486',
    'object_id': 'MP:0005391',
    'phenodigm_score': '1.270458034217462',
    'subject_id': 'MP:0006144'}}},
 'average_score': 4.361838153856265,
 'best_score': 6.050689168215567,
 'metric': 'ancestor_information_content'}

In [ ]: