Name
..
Abi
Ace
Affy
BWA
BioSQL
Blast
Blat
CDAO
Cellosaurus
Clustalw
Cluster
CodonUsage
Compass
EMBL
Emboss
Entrez
Enzymes
Exonerate
ExtendedPhylip
FSSP
Fasta
GFF
GenBank
Geo
Graphics
Hmmer
IntelliGenetics
InterProScan
KEGG
MAF
Mauve
Medline
MetaTool
Motif
NBRF
NeXML
NeuralNetwork
Nexus
PAML
PDB
Phd
Phylip
PhyloXML
PopGen
Prosite
Quality
Rebase
Registry
Roche
SCOP
Saf
SamBam
SeqXML
Stockholm
SubsMat
SwissProt
TreeConstruction
UniGene
UniProt
Wise
codonalign
motifs
output
phenotype
tmp_MAF
.coveragerc
.flake8
biosql.ini.appveyor
biosql.ini.sample
common_BioSQL.py
common_BioSQL_online.py
requires_internet.py
requires_wise.py
run_tests.py
search_tests_common.py
seq_tests_common.py
test_Ace.py
test_Affy.py
test_AlignIO.py
test_AlignIO_ClustalIO.py
test_AlignIO_EmbossIO.py
test_AlignIO_FastaIO.py
test_AlignIO_MauveIO.py
test_AlignIO_PhylipIO.py
test_AlignIO_convert.py
test_AlignInfo.py
test_Application.py
test_BWA_tool.py
test_BioSQL_MySQLdb.py
test_BioSQL_MySQLdb_online.py
test_BioSQL_mysql_connector.py
test_BioSQL_mysql_connector_online.py
test_BioSQL_psycopg2.py
test_BioSQL_psycopg2_online.py
test_BioSQL_sqlite3.py
test_BioSQL_sqlite3_online.py
test_CAPS.py
test_CelFile.py
test_Chi2.py
test_ClustalOmega_tool.py
test_Clustalw_tool.py
test_Cluster.py
test_CodonTable.py
test_CodonUsage.py
test_ColorSpiral.py
test_Compass.py
test_Consensus.py
test_Crystal.py
test_DSSP_tool.py
test_Dialign_tool.py
test_EMBL_unittest.py
test_Emboss.py
test_EmbossPhylipNew.py
test_EmbossPrimer.py
test_Entrez.py
test_Entrez_online.py
test_Entrez_parser.py
test_Enzyme.py
test_ExPASy.py
test_FSSP.py
test_Fasttree_tool.py
test_File.py
test_GACrossover.py
test_GAMutation.py
test_GAOrganism.py
test_GAQueens.py
test_GARepair.py
test_GASelection.py
test_GenBank.py
test_GenBank_unittest.py
test_GenomeDiagram.py
test_GraphicsBitmaps.py
test_GraphicsChromosome.py
test_GraphicsDistribution.py
test_GraphicsGeneral.py
test_HMMCasino.py
test_HMMGeneral.py
test_KDTree.py
test_KEGG.py
test_KEGG_online.py
test_KGML_graphics.py
test_KGML_graphics_online.py
test_KGML_nographics.py
test_KeyWList.py
test_Location.py
test_LogisticRegression.py
test_MSAProbs_tool.py
test_MafIO_index.py
test_Mafft_tool.py
test_MarkovModel.py
test_Medline.py
test_Muscle_tool.py
test_NACCESS_tool.py
test_NCBITextParser.py
test_NCBIXML.py
test_NCBI_BLAST_tools.py
test_NCBI_qblast.py
test_NNExclusiveOr.py
test_NNGene.py
test_NNGeneral.py
test_NaiveBayes.py
test_Nexus.py
test_PAML_baseml.py
test_PAML_codeml.py
test_PAML_tools.py
test_PAML_yn00.py
test_PDB.py
test_PDBList.py
test_PDB_FragmentMapper.py
test_PDB_KDTree.py
test_PDB_MMCIF2Dict.py
test_PDB_MMCIFParser.py
test_PDB_Polypetide.py
test_PDB_ResidueDepth.py
test_PDB_StructureAlignment.py
test_PDB_Superimposer.py
test_PDB_vectors.py
test_ParserSupport.py
test_Pathway.py
test_Phd.py
test_Phylo.py
test_PhyloXML.py
test_Phylo_CDAO.py
test_Phylo_NeXML.py
test_Phylo_matplotlib.py
test_Phylo_networkx.py
test_PopGen_GenePop.py
test_PopGen_GenePop_EasyController.py
test_PopGen_GenePop_nodepend.py
test_Prank_tool.py
test_Probcons_tool.py
test_ProtParam.py
test_QCPSuperimposer.py
test_RCSBFormats.py
test_Restriction.py
test_SCOP_Astral.py
test_SCOP_Cla.py
test_SCOP_Des.py
test_SCOP_Dom.py
test_SCOP_Hie.py
test_SCOP_Raf.py
test_SCOP_Residues.py
test_SCOP_Scop.py
test_SCOP_online.py
test_SVDSuperimposer.py
test_SearchIO_blast_tab.py
test_SearchIO_blast_tab_index.py
test_SearchIO_blast_text.py
test_SearchIO_blast_xml.py
test_SearchIO_blast_xml_index.py
test_SearchIO_blat_psl.py
test_SearchIO_blat_psl_index.py
test_SearchIO_exonerate.py
test_SearchIO_exonerate_text_index.py
test_SearchIO_exonerate_vulgar_index.py
test_SearchIO_fasta_m10.py
test_SearchIO_fasta_m10_index.py
test_SearchIO_hmmer2_text.py
test_SearchIO_hmmer2_text_index.py
test_SearchIO_hmmer3_domtab.py
test_SearchIO_hmmer3_domtab_index.py
test_SearchIO_hmmer3_tab.py
test_SearchIO_hmmer3_tab_index.py
test_SearchIO_hmmer3_text.py
test_SearchIO_hmmer3_text_index.py
test_SearchIO_interproscan_xml.py
test_SearchIO_model.py
test_SearchIO_write.py
test_SeqFeature.py
test_SeqIO.py
test_SeqIO_AbiIO.py
test_SeqIO_FastaIO.py
test_SeqIO_Insdc.py
test_SeqIO_PdbIO.py
test_SeqIO_QualityIO.py
test_SeqIO_SeqXML.py
test_SeqIO_convert.py
test_SeqIO_features.py
test_SeqIO_index.py
test_SeqIO_online.py
test_SeqIO_write.py
test_SeqRecord.py
test_SeqUtils.py
test_Seq_objs.py
test_SffIO.py
test_SubsMat.py
test_SwissProt.py
test_TCoffee_tool.py
test_TogoWS.py
test_TreeConstruction.py
test_Tutorial.py
test_UniGene.py
test_Uniprot.py
test_Wise.py
test_XXmotif_tool.py
test_align.py
test_bgzf.py
test_cellosaurus.py
test_codonalign.py
test_geo.py
test_kNN.py
test_lowess.py
test_mmtf.py
test_mmtf_online.py
test_motifs.py
test_motifs_online.py
test_pairwise2.py
test_pairwise_aligner.py
test_phenotype.py
test_phenotype_fit.py
test_phyml_tool.py
test_prodoc.py
test_prosite1.py
test_prosite2.py
test_psw.py
test_raxml_tool.py
test_samtools_tool.py
test_seq.py
test_translate.py
test_trie.py