Name
philippbayer's repositories
.github
Aliases
Requirements
.travis.yml
Jenkinsfile
LICENSE
README.md
_config.yml
a5.rb
abacas.rb
abinit.rb
abyss-explorer.rb
abyss.rb
acado.rb
ace-corrector.rb
adam.rb
adapterremoval.rb
adol-c.rb
afra.rb
alembic.rb
alglib.rb
allpaths-lg.rb
alpscore.rb
amos.rb
ampl-mp.rb
analysis.rb
andi.rb
ann.rb
anvio.rb
apophenia.rb
aragorn.rb
arb.rb
arcs.rb
aribas.rb
armadillo.rb
arow++.rb
arpack.rb
arrayfire.rb
art.rb
artemis.rb
ascii_plots.rb
astral.rb
astrometry-net.rb
ate-pairing.rb
atomic-pseudopotential-engine.rb
atompaw.rb
atpdec.rb
atram.rb
augustus.rb
bact.rb
bali-phy.rb
bam-readcount.rb
bamhash.rb
bamm.rb
bamtools.rb
bamutil.rb
barrnap.rb
bayestraits.rb
bbtools.rb
bcalm.rb
bcftools.rb
beagle.rb
beast.rb
beast2.rb
bedops.rb
bedtools.rb
beetl.rb
bfc.rb
bioawk.rb
biobloomtools.rb
biocgal.rb
biointerchange.rb
biomake.rb
biopieces.rb
biopp.rb
bitseq.rb
blasr.rb
blast.rb
blat.rb
blaze-lib.rb
bless.rb
blis.rb
boost-compute.rb
bowtie.rb
bowtie2.rb
bpel2owfn.rb
bpipe.rb
breseq.rb
busco.rb
butterflow.rb
bwa.rb
bwtdisk.rb
calculix-ccx.rb
cantera.rb
canu.rb
cap3.rb
ccfits.rb
cd-hit.rb
cddlib.rb
cdo.rb
cdsclient.rb
cegma.rb
celera-assembler.rb
centrifuge.rb
ceres-solver.rb
cerulean.rb
cfitsio.rb
cgns.rb
circlator.rb
circle.yml
circos.rb
ckon.rb
clark.rb
clblas.rb
clfft.rb
clinfo.rb
clonalframeml.rb
clonehd.rb
clustal-omega.rb
clustal-w.rb
cmdstan.rb
cminpack.rb
cmor.rb
coinmp.rb
colpack.rb
concorde.rb
corset.rb
cp2k.rb
cppad.rb
crfsuite.rb
crlibm.rb
cryptoverif.rb
cuba.rb
cube.rb
cufflinks.rb
cusp.rb
cvblob.rb
cytoscape.rb
dadadodo.rb
daligner.rb
data-science-toolbox.rb
datamash.rb
dazz_db.rb
dealii.rb
deeplearning4j-cli.rb
delly.rb
des.rb
dextractor.rb
dgtal.rb
diamond.rb
dida.rb
discovar.rb
discovardenovo.rb
dl_poly_classic.rb
dlib.rb
dotwrp.rb
ds9.rb
dsdp.rb
dsk.rb
dssp.rb
dwgsim.rb
dynare.rb
e-mem.rb
ea-utils.rb
edena.rb
edirect.rb
einspline.rb
elemental.rb
elph.rb
emboss.rb
enblend-enfuse.rb
ensembl-tools.rb
ess.rb
etsf_io.rb
exabayes.rb
exonerate.rb
express.rb
fann.rb
fasta.rb
fastml.rb
fastq-tools.rb
fastqc.rb
fasttree.rb
fastuniq.rb
fastx_toolkit.rb
fcgene.rb
fermi-lite.rb
fermi.rb
fermi2.rb
fermikit.rb
fgsl.rb
field3d.rb
flann.rb
flash.rb
flint.rb
flux-simulator.rb
formula_renames.json
fplll.rb
fqzcomp.rb
freebayes.rb
freec.rb
fsa.rb
fwdpp.rb
g2o.rb
gaemr.rb
galfit.rb
galib.rb
galsim.rb
gap.rb
garli.rb
gatb.rb
gatk.rb
gdcm.rb
geant4.rb
geda-gaf.rb
geneid.rb
genet.rb
genewise.rb
genometools.rb
getdp.rb
gfan.rb
ggobi.rb
giira.rb
gingr.rb
glimmer3.rb
glimmerhmm.rb
glpk.rb
glpk448.rb
gmap-gsnap.rb
gmcloser.rb
gmsh.rb
gmt.rb
gmt4.rb
gmtk.rb
gnuastro.rb
gnudatalanguage.rb
grabix.rb
graph-tool.rb
graphlan.rb
gromacs.rb
gtsam.rb
gubbins.rb
h5utils.rb
harry.rb
harvest-tools.rb
hdf4.rb
hdf5.rb
hdf5@1.8.rb
healpix.rb
hisat.rb
hisat2.rb
hlaminer.rb
hmmer.rb
hmmer2.rb
hopdm.rb
hotspot.rb
htsbox.rb
htslib.rb
humann2.rb
hwloc.rb
hyphy.rb
hypre.rb
idba.rb
idcoefs.rb
igraph.rb
igv.rb
igvtools.rb
impute2.rb
infernal.rb
insighttoolkit.rb
inter-views.rb
ipopt.rb
iqtree.rb
itensor.rb
itsol.rb
iva.rb
jblas.rb
jellyfish-1.1.rb
jellyfish.rb
jmol.rb
joinx.rb
jsbsim.rb
k8.rb
kaiju.rb
kalign.rb
kallisto.rb
kat.rb
kent-tools.rb
kissplice.rb
kmacs.rb
kmc.rb
kmergenie.rb
kmerstream.rb
kollector.rb
kraken.rb
lammps.rb
lapack-manpages.rb
last.rb
lastz.rb
libbi.rb
libbigwig.rb
libbuddy.rb
libccd.rb
libcerf.rb
libctl.rb
libdivsufsort.rb
libeemd.rb
libfolia.rb
libgpkg.rb
liblbfgs.rb
libmatio.rb
libminc.rb
libpll.rb
libsbml.rb
libsbol.rb
libsequence.rb
libsigrokdecode.rb
lie.rb
lighter.rb
lightstringgraph.rb
links-scaffolder.rb
lis.rb
littler.rb
lmfit.rb
lmod.rb
lobstr.rb
lola.rb
lp_solve.rb
lsd.rb
lumpy-sv.rb
m4ri.rb
macse.rb
mad-x.rb
madlib.rb
mafft.rb
maker.rb
mallet.rb
mantaflow.rb
mapsembler2.rb
maq.rb
mash.rb
masurca.rb
mathgl.rb
mathomatic.rb
matplotlib.rb
maude.rb
maxima.rb
mbsystem.rb
mcl.rb
med-file.rb
megahit.rb
megam.rb
meme.rb
meraculous.rb
metaphlan.rb
methpipe.rb
metis.rb
metis4.rb
mfem.rb
mfusg.rb
mhap.rb
minced.rb
minia.rb
miniasm.rb
minimap.rb
mir-prefer.rb
mira.rb
mitofy.rb
mlpack.rb
mlst.rb
moab.rb
molden.rb
moose.rb
mothur.rb
mpsolve.rb
mrbayes.rb
mrfast.rb
msieve.rb
mtl.rb
multi-worm-tracker.rb
mummer.rb
mumps.rb
muscle.rb
nanopolish.rb
nauty.rb
ncbi-c++-toolkit.rb
nccmp.rb
ncl.rb
nco.rb
ncview.rb
nest.rb
netcdf.rb
neuron.rb
newick-utils.rb
newicktools.rb
nextflow.rb
nexusformat.rb
nfft.rb
nglib.rb
niftilib.rb
nip2.rb
nixio.rb
nlopt.rb
nonpareil.rb
novoalign.rb
ntcard.rb
numdiff.rb
nusmv.rb
nxtrim.rb
oases.rb
oce.rb
ococo.rb
octave.rb
ogdraw.rb
oma.rb
omcompiler.rb
ome-common.rb
ome-files.rb
ome-xml.rb
openalpr.rb
openblas.rb
openbr.rb
opencascade.rb
opencollada.rb
opencv.rb
opencv3.rb
openfst.rb
opengrm-ngram.rb
opengrm-thrax.rb
openimageio.rb
openmeeg.rb
openni.rb
openni2.rb
orocos-kdl.rb
orthofinder.rb
osgearth.rb
oswitch.rb
p4est.rb
packmol.rb
paml.rb
pandaseq.rb
parallel-netcdf.rb
paraview.rb
parmetis.rb
parsnp.rb
pastix.rb
pathd8.rb
pathvisio.rb
paxtools.rb
pbsuite.rb
pcap.rb
pcb.rb
pcl.rb
pear.rb
perf.rb
petsc.rb
phipack.rb
phlawd.rb
phylip.rb
phyml.rb
phyutility.rb
phyx.rb
picard-tools.rb
piler.rb
pilercr.rb
pillow.rb
pilon.rb
plasma.rb
platypusvar.rb
plink.rb
plink2.rb
plr.rb
pnapi.rb
poa.rb
pocl.rb
populations.rb
poretools.rb
prank.rb
primer3.rb
prodigal.rb
prokka.rb
prooftree.rb
proteinortho.rb
proverif.rb
psmc.rb
pspp.rb
pulseview.rb
pykep.rb
pymol.rb
qcl.rb
qhull.rb
qr_mumps.rb
qrupdate.rb
qsopt.rb
qsopt_ex.rb
quaff.rb
quake.rb
qualimap.rb
quast.rb
quest.rb
quicktree.rb
quip.rb
quorum.rb
r-gui.rb
r.rb
r8s.rb
racon.rb
radx.rb
rainbow.rb
rampart.rb
rapsearch2.rb
rate4site.rb
raxml.rb
ray.rb
rcorrector.rb
readseq.rb
readsim.rb
reapr.rb
recon.rb
repeatmasker.rb
repeatmodeler.rb
repeatscout.rb
rmblast.rb
rml-mmc.rb
rna-star.rb
rnammer.rb
root.rb
root6.rb
ropebwt.rb
ropebwt2.rb
rstudio-server.rb
sailfish.rb
sais.rb
sally.rb
salmon.rb
salt.rb
sambamba.rb
samblaster.rb
samtools-0.1.rb
samtools.rb
sara.rb
sbagen.rb
scalapack.rb
scamp.rb
scarpa.rb
scotch.rb
scotch5.rb
scram.rb
scrm.rb
sdsl-lite.rb
seq-gen.rb
seqan.rb
seqdb.rb
seqtk.rb
sequel.rb
sextractor.rb
sfscode.rb
sga.rb
shark.rb
shogun.rb
shrimp.rb
sickle.rb
sigrok-cli.rb
silo.rb
simpleitk.rb
simulate-pcr.rb
siril.rb
sisl.rb
skewer.rb
slepc.rb
slicot.rb
sllib.rb
smalt.rb
smrtanalysis.rb
snap-aligner.rb
snap.rb
snid.rb
snoscan.rb
snp-sites.rb
snpeff.rb
soapdenovo.rb
sollya.rb
soplex.rb
sortmerna.rb
spaced.rb
spades.rb
spatialite-gis.rb
spici.rb
squeezambler.rb
sratoolkit.rb
ssake.rb
stacks.rb
statismo.rb
stiff.rb
stringtie.rb
suite-sparse.rb
sumo.rb
sundials.rb
superlu.rb
superlu43.rb
superlu_dist.rb
superlu_mt.rb
swarm.rb
swetest.rb
swrcfit.rb
symengine.rb
symphony.rb
t-coffee.rb
tabtk.rb
tagdust.rb
tamarin-prover.rb
tap_migrations.json
tasr.rb
tbl2asn.rb
tensorflow.rb
tetgen.rb
therion.rb
ticcutils.rb
timbl.rb
tisean.rb
tmv-cpp.rb
topcat.rb
tophat.rb
trans-abyss.rb
trans_proteomic_pipeline.rb
transdecoder.rb
transfig.rb
transpose.rb
transrate-tools.rb
transtermhp.rb
trf.rb
triangle.rb
trilinos.rb
trimadap.rb
trimal.rb
trimmomatic.rb
trinity.rb
trnascan.rb
ucsc-genome-browser.rb
ucto.rb
unafold.rb
uniqtag.rb
uproc.rb
utgb.rb
vague.rb
varscan.rb
vcake.rb
vcfanno.rb
vcflib.rb
vcftools.rb
veclibfort.rb
velvet.rb
velvetoptimiser.rb
viennarna.rb
vigra.rb
vips.rb
vislcg3.rb
visp.rb
voro++.rb
vsearch.rb
vt.rb
vtk.rb
wcalc.rb
wcslib.rb
wcstools.rb
weblogo.rb
wfdb.rb
wiggletools.rb
wopr.rb
wxmaxima.rb
xbyak.rb
xcdf.rb
xfig.rb
xmgredit.rb
xmi-msim.rb
xraylib.rb
xrmc.rb
xylib.rb
yaggo.rb
yaha.rb
yass.rb
yeppp.rb
zoltan.rb

branch

tag